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芒果全基因组SNP标记助力种质精准鉴定
作者:柳凤 来源:南亚热带作物研究所 日期:2026-08-14


近日,中国热科院南亚所园艺产品保鲜与加工研究室成功开发了芒果全基因组范围内的SNP标记,为芒果种质资源鉴定和分子育种提供了高效“分子工具”。


芒果是全球重要经济水果,但传统形态鉴定难以区分大量近缘品种,限制了种质资源利用和新品种选育。研究团队首次在全基因组层面筛选出272个高质量SNP位点,并优化出85个新型PARMS-SNP标记,最终确定16个核心标记,可快速构建145份芒果种质的DNA指纹图谱。这一套“分子身份证”能够精准识别不同品种,显著提高种质资源鉴定效率,为后续抗性、品质等优良性状的标记辅助育种奠定基础,对推动芒果产业品种创新和种质资源保护具有重要实用价值。

 

 image.png

图1 20条染色体上SNP标记的位置


 image.png

图2 基于16对核心标记的145个芒果种质资源指纹图谱

 

相关研究成果以“Development and Application of whole Genome SNP markers in Mango”为题发表于《BMC Genomics》。中国热科学院南亚所柳凤副研究员为论文第一作者,姚全胜研究员和热带作物生物育种全国重点实验室詹儒林研究员为共同通讯作者。项目研究得到了广东省重点领域研发计划(2022B0202070002)、国家热带作物生物育种重点实验室项目(NKLTCBCXTD10)和中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(1630062024020)的资助。

 

全文链接:https://link.springer.com/article/10.1186/s12864-026-13182-z

 


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    芒果全基因组SNP标记助力种质精准鉴定
    作者:柳凤 来源:南亚热带作物研究所 发表时间:2026-08-14 点击:
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    近日,中国热科院南亚所园艺产品保鲜与加工研究室成功开发了芒果全基因组范围内的SNP标记,为芒果种质资源鉴定和分子育种提供了高效“分子工具”。


    芒果是全球重要经济水果,但传统形态鉴定难以区分大量近缘品种,限制了种质资源利用和新品种选育。研究团队首次在全基因组层面筛选出272个高质量SNP位点,并优化出85个新型PARMS-SNP标记,最终确定16个核心标记,可快速构建145份芒果种质的DNA指纹图谱。这一套“分子身份证”能够精准识别不同品种,显著提高种质资源鉴定效率,为后续抗性、品质等优良性状的标记辅助育种奠定基础,对推动芒果产业品种创新和种质资源保护具有重要实用价值。

     

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    图1 20条染色体上SNP标记的位置


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    图2 基于16对核心标记的145个芒果种质资源指纹图谱

     

    相关研究成果以“Development and Application of whole Genome SNP markers in Mango”为题发表于《BMC Genomics》。中国热科学院南亚所柳凤副研究员为论文第一作者,姚全胜研究员和热带作物生物育种全国重点实验室詹儒林研究员为共同通讯作者。项目研究得到了广东省重点领域研发计划(2022B0202070002)、国家热带作物生物育种重点实验室项目(NKLTCBCXTD10)和中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(1630062024020)的资助。

     

    全文链接:https://link.springer.com/article/10.1186/s12864-026-13182-z

     


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